En 1792, le gouvernement du Bas-Canada divisa en cantons le comté de Buckinghamshire situé entre les rivières Chaudière et Richelieu dans le but d’offrir ces terres aux Loyalistes (colons américains voulant rester fidèles à l’Angleterre) venus du Maine, du Vermont, du New Hampshire et de l’état de New York. Ces cantons prirent les noms de Thetford, Tring, Shenley, Stratford, etc. Le canton de Wotton fut baptisé ainsi du nom d’un petit bourg du sud de l’Angleterre¹. Les cantons éloignés de la frontière américaine et difficiles d’accès, tels Wotton, Ham, Stratford, etc. ne furent pas concédés aux Loyalistes et restèrent inhabités jusqu’au milieu du 19e siècle. Il a fallu attendre tout ce temps avant que le gouvernement, sous l’influence de Louis Hippolyte Lafontaine, ne décide à donner des lots de 50 acres dans les cantons de Wotton, Garthby, Ham, Stratford, Winslow et Weedon à des colons canadiens-français dans le but de mettre un terme à l’émmigration aux États-Unis². Le premier colon à s’installer à Wotton fut Patrick O’Bready, époux de Odile Pelletier, qui s’y établit en 1848³. Un an plus tard, Wotton compte déjà 40 familles⁴.

La première messe à Wotton fut dite en 1849 dans la maison de David Baril par le curé de Kingsey, Pierre-Jacques Bédard⁵. Une première chapelle est ouverte en 1851⁶, puis remplacée par une première église en 1859⁷. Cette première église fut bénie par Mgr Thomas Cook le 14 septembre 1859⁸. L’église actuelle fut ouverte au culte en 1903. Sa valeur patrimoniale est exceptionnelle d’après le Conseil du patrimoine religieux du Québec⁹. Les registres s’ouvrent le 27 décembre 1851 avec le baptême de Christianne Célina Lambert¹⁰. La paroisse accueille son premier curé permanent, Georges Jacques-Duhaut, en 1852; ce dernier avait aussi sous sa responsabilité les missions de Saint-Camille, Garthby, Weedon et Dudswell¹¹. Le deuxième curé fut Hilaire-Casimir Hamelin qui demeura en poste pendant 46 ans, de 1857 à 1903¹². L’école primaire du village porte son nom. La paroisse Saint-Hippolyte fut érigée canoniquement le 26 mars 1856¹³. Son rappelle celui de Louis Hippolyte Lafontaine¹⁴. La paroisse Saint-Hippolyte a été dissoute en 2012 et rattachée à la nouvelle paroisse Coeur-Immaculé-de-Marie.

Le township de Wotton fut érigé le 1 juillet 1855. Le premier conseil municipal fut formé par François St-Jean, maire, et de Georges Lahaie, Louis Lemire, Louis Bilodeau, Placide Légère, Olivier Longval et Augustin Martel, conseillers¹⁵. En 1859, une partie du territoire de Wotton est détachée pour former le township de St. Camille¹⁶. Le village de Wottonville, détaché du township de Wotton, fut érigé le 12 février 1919. Le premier conseil fut composé de Alphonse Thibeault, maire, et de Joseph Laliberté, Sinaï Goulet, Joseph Gendron, Casimir Corbeil, Ephrem Vigeant et J.A. Plourde, conseillers¹⁷. Le 15 mars 1969, le township de Wotton change de statut et devient le canton de Wotton¹⁸. Le 10 mars 1993, le canton de Wotton et le village de Wottonville ont fusionné pour former la municipalité de Wotton¹⁹.